Датой основания службы охраны УИС, как самостоятельного подразделения, принято считать 30 июня 1994 года – в этот день, на основании приказа МВД России функции охраны исправительных учреждений были переданы органам уголовно-исполнительной системы. До этого времени функции охраны осуществляли внутренние войска МВД России.